Continente - Não inscrição das faturas no portal da autoridade tributária

informo que sou cliente assíduo do continente e,este ano não foi registada uma única fatura no portal das finanças com determina a nova lei do irs.o que me levou a registar algumas por terem ultrapassado os dois meses.já me informei na repartição de finanças onde me responderam que não tinham conhecimento de nenhuma anomalia,mas que eu poderia fazer os registos sem problemas..o que acontece é que tenho de guardar as faturas por mim registadas durante 4 anos,mas a tinta das mesma desaparece passadas poucas semanas..como poderei guardar as mesmas????tenho de fazer fotocopias das mesmas???vai ficar um pouco dispendioso...O COMERCIANTE NÃO É OBRIGADO AO REGISTO DAS MESMAS FATURAS??? sem mais agradeço a informação possível que me possam dar..obrigado.